深圳地铁在运营中出现亏损的情况，其原因较为复杂。首先，地铁的建设和运营涉及多方面的成本，包括建设成本、维护成本和运营成本。特别是建设成本，如《深圳市城市轨道交通20号线一期工程环境影响报告书》所示，每公里的建设成本高达14.8亿，这使得整体投资巨大。此外，深圳地铁还对地铁周边的房地产和商业进行了大量投资，这也增加了其经营的压力。
另一方面，深圳地铁的部分线路可能并未达到预期的人流量，特别是在边缘地区。这可能导致了资源浪费和防范地方债务泛滥的问题，因此有四条边缘地铁线被砍掉。同时，如果一个城市的财政无法提供相应的财政补贴，地铁的票价可能会偏高，从而导致乘用率下降，进一步加剧亏损的情况。
然而，值得注意的是，尽管存在上述问题，深圳地铁在2019年仍然实现了营业收入超过207亿元，利润总额达到117亿元，成为国内各大地铁集团公司中盈利最多的地铁企业。这表明，深圳地铁在经营管理上也存在相应的优势和策略。
