如果男女双方未领取结婚证，但在事实上已经共同生活并生育了孩子，孩子的抚养权问题可以通过法律途径解决。法院会根据双方的实际情况和孩子的最佳利益，按照最有利于孩子的原则进行判决。
在实践中，法院通常会考虑以下因素来判决孩子的抚养权归属：
1. 哺乳期内的子女，也就是不满周岁的子女，原则上由女方抚养。
2. 两周岁以下的子女，一般随女方生活。
此外，尽管双方没有办理结婚登记手续，在法律上不存在婚姻关系，但非婚生子女与婚生子女享有同等的权利义务。因此，父母双方都有责任承担孩子的抚养费用，确保孩子的生活和教育得到妥善安排。
